Vous incarnez Tidus, un jeune joueur de Blitzball, très doué par ailleurs. Débordant d'énergie et très joyeux, il fera rapidement la rencontre de Yuna, le personnage principal autour duquel le scénario repose. Celle-ci est une Invokeur, ce qui n'est guère étonnant étant donné que son père, Braska, fut un célèbre sorcier. Hantée par d'étranges rêves, pour ne pas dire des cauchemars, elle cherche à les comprendre et pour cela part à la recherche de Sin dans le but de le vaincre. Pour ce faire, elle souhaite se rendre dans les différents temples de la religion Yevon, afin d'y acquérir les Chimères. Ces dernières sont de puissants " esprits ", disposant d'incroyables pouvoirs. C'est en réunissant leur puissance qu'elle pourra invoquer l'Ultime Chimère, la seule capable de vaincre Sin. Ce voyage à travers le monde sera également l'occasion d'acquérir expérience, savoir et sagesse.
Tidus et Yuna ne sont pas seul durant leur aventure, cinq autres personnages se joindront à eux :
- Auron, un des gardiens de Braska.
- Lulu, une magicienne maîtrisant la magie noire et combattant à l'aide d'une poupée qui pourra représenter un Mog, un Moomba, un Pampa voire même Cait Sith !
- Wakka, le capitaine de l'équipe de Blitzball de Besaid.
- Kimahri Ronso, un des gardiens de Yuna et originaire du Mont Gagazet, patrie du peuple Ronso.
- Rikku, une intrépide voleuse Al Bhed, qui ne manque pas de charme.




